Николай Попов участвует в целом ряде исполнительских и образовательных проектов, а также регулярно выступает с новыми инициативами.
Оркестр Большого театра
С 2012 года Николай Попов является солистом оркестра Большого театра. В его репертуаре — практически все оперы и балеты, идущие в Большом театре.
Духовой квинтет Большого театра
В 2013 году руководство Большого Театра России приняло решение воссоздать Духовой квинтет Большого театра. В состав ансамбля вошли лучшие солисты-духовики не только оркестра ГАБТ, но и страны: Николай Попов (флейта), Сергей Лысенко (гобой), Сергей Петров (кларнет), Андрей Рудометкин (фагот), Алексей Раев (валторна).
Весной 2013 года в Бетховенском зале Большого театра прошел цикл из трех концертов, в котором исполнители были представлены как солисты, а в качестве кульминации цикла выступили квинтетом. Эти концерты стали презентацией Квинтета.
Уже сейчас в репертуаре коллектива большое количество как классических произведений для этого состава — квинтеты Лядова, Рубинштейна, Чайковского (сюита из балета «Щелкунчик»), Мусоргского («Картинки с выставки») и Прокофьева (сюита из балета «Ромео и Джульетта»), Светланова («Деревенские сутки»), Рейхи, Данци, Реслера, Брамса, Нильсена, Барбера, Вилла-Лобоса, Хиндемита и т.д.
Московский флейтовый центр
Николай Попов ведет достаточно активную педагогическую деятельность и старается популяризировать игру на флейте среди самых разных людей, возрастов и профессий. Николай считает это значительной частью своей творческой миссии, реализовывать которую он собирается в том числе и в рамках Московского Флейтового Центра.
Летняя школа ЦМШ
В рамках Международной летней школы ЦМШ при МГК им. П. И. Чайковского в августе 2017 года Николай Попов откроет флейтовую мастерскую.